Rekrutacja uzupełniająca na stypendia grantowe
Doktorant/Doktorantka w Zakładzie Bioinżynierii Komórek Macierzystych
Miejsce pracy: Warszawa
Data ogłoszenia: 22.01.2025
Termin składania ofert: 1.03.2025
Format składania ofert: email
Termin rozpoczęcia pracy: 01.04.2025 lub później*
* Dopuszczamy współpracę ze studentką/em studiów magisterskich w ramach praktyk i jej/jego aplikację na doktorat po uzyskaniu tytułu magistra w 2025 r.
Liczba pozycji: 2
Link do strony Zakładu: https://imdik.pan.pl/pl/zaklady-badawcze/208-zaklad-bioinzynierii-komorek-macierzystych oraz grupy dr hab. Magdaleny Czeredys: Magdalena_Czeredys_Huntington’s_disease_group.doc
Opis projektu:
Projekt, zatytułowany „Assembloidy korowo-striatalne pochodzące z ludzkich iPSCs jako nowy model do badań zaburzeń neurorozwojowych wywoływanych przez zmutowaną huntingtynę”, pod kierunkiem dr hab. Magdaleny Czeredys realizowany będzie w Zakładzie Bioinżynierii Komórek Macierzystych w Instytucie Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej PAN. Pląsawica Huntingtona (HD) jest nieuleczalną, dziedziczną chorobą neurodegeneracyjną. Choroba ta charakteryzuje się nieprawidłową liczbą powtórzeń CAG kodujących glutaminę w genie HTT, co prowadzi do agregacji zmutowanego białka huntingtyny (mHTT) toksycznego dla neuronów MSNs w prążkowiu, strukturze mózgu odpowiedzialnej za funkcje motoryczne, która jako pierwsza w HD ulega neurodegeneracji. Występują dwie formy HD o różnym początku choroby: forma dorosła, gdzie liczba CAG wynosi powyżej 40 powtórzeń a symptomy pojawiają się w wieku 30-50 lat, oraz młodzieńcza charakteryzująca się CAG powyżej 60, a objawy występują poniżej 21 roku życia, a nawet we wczesnym dzieciństwie. Huntingtyna jest niezbędna w rozwoju mózgu, a jej brak skutkuje śmiercią myszy na etapie embrionalnym, co sugeruje że HD może mieć swój początek podczas rozwoju mózgu. Patogeneza tej choroby nie jest w pełni zrozumiana, a skuteczne metody leczenia przyczynowego nadal nie istnieją. W projekcie postawiono hipotezę, że wczesne zaburzenia neurorozwojowe mózgu spowodowane przez różne długości powtórzeń CAG w genie HTT występujące w młodzieńczej i dorosłej formie choroby Huntingtona inicjują HD i prowadzą do obumierania neuronów MSNs. W celu zrozumienia, czy patologia HD rozpoczyna się podczas rozwoju mózgu zostaną uzyskane in vitro organoidy i assembloidy modelujące HD, w których zostanie zbadany wpływ mutacji w genie HTT na patologię neurorozwojową, dysregulację sygnalizacji wapniowej, neurozapalenie, zaburzenia synaptyczne, oraz śmierć MSNs. Projekt będzie realizowany z użyciem modeli 3D zróżnicowanych in vitro z hiPSC od pacjentów HD i kontrolnych, przy podejściu badawczym obejmującym techniki takie jak m.in. obrazowanie przyżyciowe organoidów i assembloidów, obrazowanie odpowiedzi wapniowej, edycja genów, scRNAseq, a także techniki biochemii i biologii molekularnej.
Opis zadań:
- hodowla linii hiPSC oraz zróżnicowanych z nich neuroprogenitórów, neuronów oraz organoidów mózgowych
- zakładanie i utrzymywanie hodowli organoidów modelujących HD
- uzyskiwanie assembloidów modelujących HD
- charakterystyka organoidów i assembloidów uzyskanych z hiPSC od pacjentów z chorobą Huntingtona w porównaniu do kontrolnych
- uzyskiwanie i charakterystyka organoidów wzbogaconych w komórki mikrogleju
- badanie zaburzeń neurorozwojowych i neurodegeneracyjnych w organoidach i assembloidach od pacjentów z chorobą Huntingtona z zastosowaniem metod biologii molekularnej, immunofluorescencji oraz przyżyciowego obrazowania mikroskopowego
- dodatkowe obowiązki będą obejmowały: ustawianie nowych metod, planowanie i przeprowadzanie eksperymentów, współpracę z członkami zespołu, prowadzenie dokumentacji laboratoryjnej, analizę danych, śledzenie na bieżąco literatury z danej dziedziny, prezentowanie wyników projektu na seminariach i konferencjach, udział w kursach i stażach naukowych, udział w pisaniu prac naukowych i raportów.
Wymagania:
- tytuł magistra w dziedzinie biologii, biochemii lub pokrewnej dziedziny
- doświadczenie w pracy laboratoryjnej i znajomość podstawowych technik z zakresu biochemii, biologii molekularnej, biologii komórki i/lub obrazowania mikroskopowego
- doświadczenie w prowadzeniu hodowli komórek
- wcześniejsze doświadczenie w hodowli hiPSCs, różnicowaniu hiPSCs do neuronów lub organoidów lub doświadczenie w modyfikacjach genetycznych komórek z użyciem CRISPR Cas9 lub innych metod edycji genomu, jak również doświadczenie w przyżyciowym obrazowaniu mikroskopowym w modelach in vitro lub in vivo zostaną uznane za znaczący atut
- mile widziane doświadczenie w scRNAseq oraz bioinformatyce
- motywacja, pasja i entuzjastyczne podejście do pracy eksperymentalnej
- umiejętność samodzielnej pracy oraz pracy zespołowej
- zdolności organizacyjne i analityczne
- biegła znajomość języka angielskiego w mowie i piśmie, umiejętność posługiwania się angielskim w pracy naukowej
- zainteresowanie chorobami neurodegeneneracyjnymi i neurorozwojowymi
- chęć uczenia się i podejmowania nowych wyzwań
- publikacje naukowe będą dodatkowym atutem, ale nie są niezbędne
- aktywny udział w konferencjach naukowych
Oferujemy:
- przyjazne, inspirujące i wspierające środowisko pracy w niedawno utworzonym, młodym i rozwojowym zespole badawczym o tematyce choroby Huntingtona w Zakładzie Bioinżynierii Komórek Macierzystych
- nowatorskie wyzwania badawcze, unikalne możliwości rozwijania umiejętności badawczych
- współpracę naukową z zagranicznymi ośrodkami naukowymi
- możliwość uczestniczenia i prezentacji wyników uzyskanych w ramach projektu na międzynarodowych konferencjach
- swobodę i samodzielność w realizowaniu powierzonych zadań
- mentoring i wsparcie w rozwoju kariery zawodowej
- możliwość ubiegania się o granty dla doktorantów
- współautorstwo w publikacjach naukowych
- pakiet benefitów, np. kartę Multisport Plus, możliwość skorzystania na preferencyjnych warunkach z ubezpieczenia grupowego
Osoba zakwalifikowana do realizacji projektu zostaje przyjęta do Szkoły Doktorskiej Medycyny Translacyjnej i uzyskuje prawa doktoranta oraz stypendium doktoranckie z grantu NCN Opus nr 2023/49/B/NZ3/04131 przez cały okres trwania projektu (48 miesięcy)
Życiorys, list motywacyjny oraz co najmniej jeden list polecający od obecnego lub byłego promotora/opiekuna naukowego należy przesłać na adres: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript. do dnia 1.03.2025. W tytule maila należy wpisać: „doktorat”. Zastrzegamy sobie możliwość zaproszenia na rozmowy kwalifikacyjne tylko wybranych kandydatów. Wnioski złożone po terminie nie będą rozpatrywane.
Na podstawie rozmowy z kandydatem kierownik projektu akceptuje kandydaturę i wyraża zgodę na wykonywanie pracy badawczej pod jego kierunkiem, co umożliwia ubieganie się o przyjęcie do Szkoły Doktorskiej Medycyny Translacyjnej (https://www.cmkp.edu.pl/ksztalcenie/wspolna-szkola-doktorska). Kandydaci muszą spełnić wymagania przewidziane w Zasadach rekrutacji opisanych na stronie https://www.cmkp.edu.pl/ksztalcenie/wspolna-szkola-doktorska/rekrutacja i pomyślnie przejść obydwa etapy rekrutacji.
Doktorant/Doktorantka w Zakładzie Komórkowej Transdukcji Sygnału
Temat: Rola receptora purynergicznego P2X7 w wywoływaniu zaburzeń metabolicznych w mózgu i w neurodegeneracji w mysim modelu choroby Parkinsona
Proponowany promotor: prof. dr hab. Agata Adamczyk
Finansowanie badań: Grant 2023/50/E/NZ4/00550 pt. Rola receptora purynergicznego P2X7 w wywoływaniu zaburzeń metabolicznych w mózgu i w neurodegeneracji w mysim modelu choroby Parkinsona;
Kierownik projektu: dr Anna Wilkaniec
Cel badań
Patologia choroby Parkinsona (PD) charakteryzuje się tworzeniem nierozpuszczalnych agregatów alfa synukleiny (α-Syn) - ciałek Lewy'ego oraz selektywną śmiercią neuronów dopaminergicznych w istocie czarnej. Patogeneza tej choroby nie jest w pełni zrozumiana, a skuteczne metody leczenia przyczynowego nadal nie istnieją. Zakłada się, że na etiologię PD wpływa interakcja różnych czynników, takich jak stres oksydacyjny, zaburzenia procesu mitofagii, kumulacja uszkodzeń mitochondrialnych oraz zaburzenia metaboliczne. Aktualne badania podkreślają istotną rolę receptora purynergicznego P2X7 (P2X7R) w mechanizmach patogenezy PD. W naszych najnowszych badaniach wykazaliśmy, że egzogenna α-Syn może bezpośrednio wiązać się z P2X7R w komórkach neuronalnych, prowadząc do wzrostu napływu wapnia do wnętrza komórki oraz indukcji stresu oksydacyjnego, co ostatecznie prowadzi do dysfunkcji mitochondrialnej. Hipoteza badawcza projektu zakłada, że zmiany w funkcjonowaniu receptora P2X7R odgrywają kluczową rolę w zaburzeniach metabolicznych związanych z neurotoksycznością α-Syn, co powoduje obumieranie neuronów dopaminergicznych obserwowane w patogenezie PD. Jest to pierwszy projekt mający na celu wyjaśnienie roli P2X7R jako molekularnego mediatora szerokiego zakresu zmian metabolicznych wywołanych przez α-Syn.
Badania będą prowadzone na dobrze scharakteryzowanym przedklinicznym modelu myszy z PD, opartym na bezpośrednim wstrzyknięciu oligomerycznej (prefibrylarnej) formy α-Syn do prążkowia oraz na pierwotnych hodowlach neuronalnych. Do badań zostaną wykorzystane myszy z nokautem genu P2X7R (P2X7RKO). Wszystkie eksperymenty będą wykonywane przy użyciu nowoczesnych, czułych technik, umożliwiających wiarygodną ocenę ilościową testów enzymatycznych, bioluminescencyjnych i fluorescencyjnych, a także konfokalnej mikroskopii, rezonansu magnetycznego (MRI), RT-PCR oraz Western blottingu.
Projekt obejmuje następujące zadania badawcze:
1. Identyfikacja roli P2X7R w indukcji stresu oksydacyjnego i zmianach w metabolizmie redoks w modelu PD in vivo.
2. Analiza roli P2X7R w regulacji odpowiedzi białkowej mitochondriów (mtUPR).
3. Analiza roli P2X7R w regulacji autofagii mitochondrialnej.
4. Analiza udziału P2X7R w zmianach metabolicznych wywołanych przez α-Syn.
5. Ocena in vivo strukturalnych i metabolicznych zmian wywołanych przez P2X7R w mózgu myszy z PD.
6. Analiza roli P2X7R w zmianach morfologicznych mózgu w PD.
7. Analiza wpływu P2X7RKO na zmiany behawioralne w modelu myszy z PD.
Opis czynności w ramach stanowiska pracy
Planowanie i wykonywanie doświadczeń
Praca twórcza polegająca na analizie bieżącej literatury, inicjowaniu zmian w trakcie realizacji projektu
Analiza i interpretacja uzyskanych danych
Prowadzenie dokumentacji wyników badań zgodnie z zasadami FAIR
Prezentowanie wyników na seminariach w Pracowni i w Instytucie oraz na krajowych i międzynarodowych konferencjach naukowych
Przygotowywanie publikacji naukowych
Wymagania
Doświadczenie w pracy laboratoryjnej w zakresie neurobiologii, biologii molekularnej
Biegła znajomość języka angielskiego w mowie i piśmie
Doskonałe umiejętności organizacyjne i dbałość o szczegóły
Umiejętność pracy indywidualnej i pracy w zespole
Dodatkowe atuty
Dorobek naukowy udokumentowany publikacjami naukowymi o zasięgu międzynarodowym w czasopismach z listy JCR
Udokumentowany czynny udział w konferencjach i sympozjach krajowych i/lub zagranicznych
Oferujemy
Stypendium naukowe w wysokości do 5000 zł/miesiąc na okres do 4 lat
Nowatorskie wyzwania badawcze, unikalne możliwości rozwijania umiejętności badawczych
Swoboda i samodzielność w realizowaniu powierzonych zadań
Mentoring i wsparcie w rozwoju kariery zawodowej
Przyjazne, inspirujące i wspierające środowisko pracy, w dużym zespole Zakładu Komórkowej Transdukcji Sygnału
Możliwość prezentacji wyników badań na konferencjach naukowych
Wsparcie w publikacji i promocji wyników badań
Pakiet benefitów, np. kartę Multisport Plus, możliwość skorzystania na preferencyjnych warunkach z ubezpieczenia grupowego
Dokumenty do złożenia
List motywacyjny zawierający informacje o zainteresowaniach naukowych, pracy naukowej, uzasadniający chęć podjęcia pracy w projekcie
CV (podpisane przez Kandydata/Kandydatkę) w formacie .pdf
Co najmniej jeden list polecający od obecnego lub byłego promotora/opiekuna naukowego
Serdecznie zapraszamy do aplikowania!
Klauzula informacyjna dotycząca przetwarzania danych osobowych.
Zgodnie z art. 13 Rozporządzenia Parlamentu Europejskiego i Rady (UE) 2016/679 z dnia 27 kwietnia 2016 r. w sprawie ochrony osób fizycznych w związku z przetwarzaniem danych osobowych i w sprawie swobodnego przepływu takich danych oraz uchylenia dyrektywy 95/46/WE (ogólne rozporządzenie o ochronie danych) dalej zwanym RODO, informujemy, że:
- Administratorem danych osobowych jest Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego PAN, 02-106 Warszawa, ul. A. Pawińskiego 5 (zwany dalej IMDiK PAN).
- W IMDiK PAN wyznaczono Inspektora Ochrony Danych, z którym można skontaktować się pod adresem mailowym: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript. lub przesyłając list na adres IMDiK PAN.
- Dane osobowe będą przetwarzane w celu przeprowadzenia przez IMDiK PAN postępowania rekrutacyjnego na stanowisko wskazane w ogłoszeniu, zakończonego ewentualnym zawarciem umowy.
- Aby przeprowadzić postępowanie rekrutacyjne, wymagamy podania następujących danych: imię (imiona) i nazwisko, data urodzenia, dane kontaktowe wskazane przez osobę ubiegającą się o zatrudnienie, wykształcenie, kwalifikacje zawodowe, przebieg dotychczasowego zatrudnienia. Ich podanie jest niezbędne dla udziału w rekrutacji, na podstawie art. 22' Kodeksu pracy (art. 6 ust. 1 lit. c RODO).
- Pozostałe dane (np. wizerunek) będą przetwarzane na podstawie Pani/Pana dobrowolnej zgody (art. 6 ust. 1 lit. a RODO), którą Pani/Pan wyraża wysyłając nam swoje zgłoszenie rekrutacyjne a ich podanie nie ma wpływu na możliwość udziału w rekrutacji. Jeżeli nie chce Pani/Pan, abyśmy przetwarzali dodatkowe dane, prosimy o nieumieszczanie ich w dokumentach.
- Zgłaszając swoją kandydaturę wyraża Pani/Pan zgodę na to, że w przypadku wygrania rekrutacji Pani/Pana imię i nazwisko wraz z informacją o rekomendacji do zatrudnienia zostanie zamieszczone na stronie internetowej IMDiK PAN.
- Dane osobowe kandydatów niewybranych w danym naborze, zawarte w dokumentach aplikacyjnych, będą przetwarzane maksymalnie do miesiąca od zakończenia procesu rekrutacji, a następnie zostaną usunięte.
- Odbiorcami danych osobowych mogą być podmioty świadczące obsługę administracyjno-organizacyjną oraz podmioty uprawnione.
- W granicach i na zasadach określonych w RODO przysługuje Pani/Panu prawo żądania dostępu do swoich danych osobowych, ich sprostowania, usunięcia lub ograniczenia przetwarzania a także prawo do złożenia oświadczenia o cofnięciu zgody na przetwarzanie danych osobowych w każdym czasie. Cofnięcie zgody nie ma wpływu na zgodność z prawem przetwarzania, którego dokonano na podstawie zgody przed jej cofnięciem, jak również na przetwarzanie danych, które administrator przetwarza na podstawie innych przepisów.
- Dane osobowe nie będą przekazywane poza Europejski Obszar Gospodarczy.
- Dane osobowe nie posłużą do zautomatyzowanego podejmowania decyzji (w tym poprzez profilowanie).
- Posiada Pani/Pan prawo wniesienia skargi do Prezesa Urzędu Ochrony Danych Osobowych (ul. Stawki 2, 00-193 Warszawa).
- W sprawie danych osobowych mogą Państwo kontaktować się z IMDiK PAN pod adresem mailowym: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript. lub przesyłając list na adres IMDiK PAN.
